Ротор на коленвалу устанавливается при монтаже в специальных оправках. Наверное эту версию нужно отмести, я имею ввиду что не тот ротор стоит. Наверное начинать нужно с правильности установки ГРМ, думаю здесь засада. От того и БУ ругается на несоответствие. Датчики становятся только в одном положении и на сколько я понимаю не регулируются. Так что и настраивать по сути не чего, у вас ведь блок управления родной от вашего мотора, а не универсальный ко всем моторам. Не может быть чтоб не было инструкций по установки ремня ГРМ.
Какие блоки вас интересуют??